Kelinci di bawah karantina atau pengobatan untuk penyakit menular harus dipisahkan dari kelinci lain sedemikian rupa untuk meminimalkan penyebaran penyakit tersebut. Hal ini bisa di karantina di bangunan yang terpisah atau di wilayah di peternakan kelinci yang sama, atau materi ditempatkan di sekitar kandang tersendiri untuk mencegah penularan penyakit.